“头好痛......”林凡不禁双手捂头，从漫长的沉睡中醒来。使劲晃了几下头，感觉头痛稍微减轻了一些，抬头向四周看了看，发现自己躺在一张硬板床上，身处十几平米大的屋子里，四壁没有窗户。整间屋子除了林凡身下躺着的硬板床再没有其他摆设，在床的正对面的墙上有一扇紧闭的门。“这是哪里？”林凡对处于这陌生的环境里感到很困惑，但稍微一想又引起一阵头疼，“呃......”无奈，林凡只好又躺回床上闭上了眼睛，放松大脑使头疼减轻。大约过了半个小时，头终于没那么疼了。林凡睁开双眼，又仔细看了下这空荡的屋子终于想起来发生的事情了...
林凡是联盟政府亚洲区的一名普通人，处于2300年的地球，随着科技的发展和对宇宙的探索，地球上众多的国家都意识到分化独立是没法得到长远发展的。所以在一百多年前也就是2200年，地球上众多的国家全部联合在了一起。取消国家，成立了联盟，有当时处于鼎盛的五个国家组成联合政府，对全球进行统一管理。
就在十年前，联合政府在宇宙中发现了一块神奇的物资，这块物质只有四个人脑那么大，呈圆球状。被宇宙矿物开采机器人从一块途径太阳系的巨型陨石中开采出来。由于此圆球不属于元素表中的任一元素，引起了联盟科技院的高度重视。高层们认为这是联盟科技发展的重大契机，是推动联盟向宇宙进军的重大发现。当即，联盟将全球各地的顶尖科学家聚于一起，对这一神奇的物质进行研究。
这块圆球虽为一体但颜色却不一，一半白，一半黑，有如阴阳鱼般紧密的结合在一起。白色部分显得圣洁而又纯净，黑色部分邪恶而又神秘。在对这块互相矛盾而又联系紧密的圆球进行了长达五年的研究之后。科学家们只研究透了白色部分的物质特性，对黑色部分所知甚少，所从下手。但就是白色部分的研究就是的整个联盟都沸腾了。研究资料现示圆球的白色部分可以使人类进化，从而使得人类向更加高级的生命进化，白色物质中蕴含着一种神奇的能量，它能使得人类的精神也可以说是灵魂进入其中，对灵魂进行强化，从而得到进化。虽然缓慢但也使人们激动不已。也许飞天遁地、排山倒海对今后的人们来说都不再是梦想，一度被科学家认为人类已经是自然界进化的最高形态了，人类将无法再进化得学说被打破，进化的极限在哪里？人们将进化成什么样子？是否可以获得超能力？等等问题引发了人们的强烈关注。全球的人们都对进化充满了期望与幻想。
在对白色物质的研究与开发中最先进化的不是人类，而是当时参与研究的第六代也是全联盟最先进的智脑“先驱”。先驱式联盟研制出来用于联系管理全球的一台超级电脑，它与每一位存于联盟人类体内的职能芯片相连，可以是全球的任梦进行沟通联系，也方便联盟的管理。本来先驱虽被称为智脑，但它并没有只会，它仍是一部计算机，一部超级计算机而已。但与科学家们在一起研究神秘圆球中，被白色物质的一次能量冲击辐射之后，逐渐产生了灵智，拥有了灵魂，可以像人类一样思考，可以说地球上没有比先驱更智慧的人了。
通过先驱与科学家们的合力研究，白色物质被定为进化结晶。它虽能引发人们进化，但实在是太缓慢了，进化结晶内的能量似乎与黑色物质相抵触。大部分能量与黑色物质也就是被认定为暗黑结晶内的能量所纠缠，无法被调用。科学家进行了一项大胆的研究那就是将黑、白两晶体进行分离，但在这之前要对进化结晶进行控制，防止一旦分离引发结晶结构不稳，进化能量扩散，对人类进行过度冲击而引发进化过快产生畸形。由于进化结晶能够容纳灵魂的特性。科学家们将先驱的灵魂从智脑中剥离出来彻底输入白色进化结晶中，与进化结晶融合，从而彻底龙智进化结晶。之后，由先驱在进化结晶中创立一个游戏世界，可以将人们的灵魂引入其中，生成游戏角色，通过打怪的方式获得进化能量从而进化升级。这样可以最大限度的吸收进化能量，加快人们进化的步伐，可以吸收的能量数据化之后形成经验，无法吸收的或超过人们吸收限度的生成武器、装备，武装人类，增强人们的实力。这一研究一经提出便得到了全球人类的赞同。进化结晶与暗黑结晶的分离被定上了日程。
在三个月前，先驱成功的控制了进化结晶，虽然游戏空间还没有生成创立，但迫不及待的科学家们就将圆球摆到了分割手术台上。想要先对黑、白结晶进行分离，使先驱可以控制全部的进化能量来生成游戏空间。对进化结晶的欣喜研究冲昏了科学家们的头脑，使他们对暗黑结晶这难啃又研究没有突破的物质至于一边，被彻底的忽视了。但能与进化结晶想抗衡的东西能普通吗。当科学家将分割激光刀将黑、白分割线被一刀切开之时。潘多拉魔盒被打开了。一半是人类进化的希望，一半又给人来带来了无法承受的灾难。由于有先驱的控制，当科学家将进化结晶与暗黑结晶分割开后，进化能量得到了有效的控制，并没有能量逸散出来。但没有控制的暗黑结晶却一下子破碎开来。在科学家们诧异的眼神注视下，两个人头打的暗黑结晶碎裂分化成了一股黑色的粉末，如黑烟一般漂浮着，在这封闭温暖的实验室里，突然有一阵冷风从在场的所有科学家心底吹过如进入寒冬一般集体打了个冷颤。黑色的粉尘再次粉碎彻底化于空气中没了踪影。
仅仅三个小时，整个学校彻底处于一种崩溃的边缘。已经达到100亿的人类在三个小时的时间里就死亡了将近一半。老人和孩子全部死亡。只剩下了青壮年。如果说死了一半的人算是混乱与恐慌的开始的话，那么接下来的时间里，人们都处于了一种疯狂与崩溃之中。已死去的任梦有重新站了起来，失去亲人陷入悲伤的人们一度以为神灵显世，将死去的亲人复活了过来，但站起来的任梦睁开血红的双眼，张开裂到耳根的巨口，扑向了脸上还带着眼泪而表情惊喜的亲人。在不解与诧异中，复活的死人又将幸存下来的青壮年代州了将近三分之一。生化危机中的场景在现实的地球上活生生的上演着。每天都有大量的人们死去，成为新的活死人。
林凡与宿舍的三个室友接着假期出游的机会，到三区野营从而躲过了最初的人吃人的危机，在灾难爆发的初期幸存了下来，之后又通过体内的芯片与先驱相连得知地球上爆发的危机后，谨慎小心的在山区度过了一个月。这场生化危机的爆发几乎毁了整个地球。幸存下来的科学家在自责之时有与先驱共同努力希望获得解救人类的办法。最后确定了一个不是办法的办法希望可以挽救被他们的愚蠢推入水深火热之中的人类，那就是先驱在进化结晶内创立游戏空间，通过与全球人类相连的芯片将幸存下来的人类灵魂拉入进化结晶里。同时对幸存下来的人类的dna进行备份保存。科学家通过一台能源储备机器将全球所有可以利用到的能源存入其中，当进化结晶内的人们进化到与现实中被暗黑结晶所魔化了的魔物想抗衡之后，有机器结合备份的dna重新生成克隆出进化晶体中的人类。彻底消灭被暗黑结晶魔化了的魔物，拯救我们的母亲－－地球。
当林凡他们通过芯片了解了整件事情的经过并得知先驱建立游戏空间和科学家制造机器共需要三个月之后之后，在不停咒骂那帮该死的科学家之时只得无奈等待先驱能早日建立起游戏避难所。
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